STT-7360 — Méthodes biostatistiques
Travail de synthèse
Présentation orale d’un article et implantation de la méthode · 30 % de la note finale.
Ces consignes sont fournies à titre indicatif. La version officielle est celle déposée sur Brio : en cas de doute ou de différence entre les deux, c’est l’information sur Brio qui prévaut.
📄 Consignes, grille et gabarit de fiche de lecture (PDF)
L’étudiant doit donner une présentation orale d’un article et remettre le code documenté de son implantation ou de son application de la méthode biostatistique décrite dans l’article. L’utilisation d’une fiche de lecture et la préparation d’exercices en lien avec l’article présenté sont encouragées.
Échéances
| Étape | Date |
|---|---|
| Choix de l’article (par courriel, avec un deuxième choix) | vendredi 19 février 2027 |
| Confirmation de l’article et de la date de présentation | vendredi 26 février 2027 |
| Dépôt du code documenté et des diapos (Brio) | la veille de la présentation, 23 h 55 |
| Présentation (20 min + 10 min de questions) | vendredi 16 ou 23 avril 2027 |
Grille de correction (100 points)
| Critère | Points |
|---|---|
| Compréhension et exposé de la méthode | 20 |
| Grille méthodologique | 10 |
| Implantation, code et reproductibilité | 25 |
| Résultats et interprétation | 15 |
| Regard critique | 10 |
| Présentation orale | 10 |
| Réponses aux questions | 10 |
Les descripteurs de niveaux (excellent, satisfaisant, insuffisant), les attentes supplémentaires au doctorat et les bonus pour la fiche de lecture et les exercices sont détaillés dans le PDF.
Articles suggérés
Un autre article méthodologique peut être choisi avec l’accord de l’enseignant. Les PDF des articles suggérés sont déposés sur Brio.
| Référence | Thème | Séances liées |
|---|---|---|
| Aktas Samur, Coskunfirat et Saka (2014), PeerJ, 2, e648 | Comparaison des GEE et des GLMM pour des réponses binaires longitudinales | 3, 6 |
| Pedroza et Truong (2017), Trials, 18, 512 | Risques relatifs dans les études multicentriques avec peu de centres ; simulation | 2, 3, 6 |
| Talbot, Mésidor, Chiu, Simard et Sirois (2022), arXiv:2112.00547 | La régression de Poisson robuste vue comme régression semi-paramétrique | 1, 6 |
| Zivich, Ross, Shook-Sa, Cole et Edwards (2024), Statistics in Medicine, 43, 5562–5572 | Variance sandwich empirique pour la g-computation ICE | 6 |
| Ristl, Hothorn, Ritz et Posch (2020), Statistical Methods in Medical Research, 29(6), 1746–1762 | Inférence simultanée pour plusieurs modèles GEE marginaux | 6, 11 |
| Joo, Hormozdiari, Han et Eskin (2016), Genome Biology, 17, 62 | Tests multiples dans les modèles linéaires mixtes (GWAS) | 3, 11 |
| Finak et coll. (2015), Genome Biology, 16, 278 | MAST : modèle en deux parties pour l’ARN de cellules uniques | 3, 11 |
| Miller, Roe, Hu et Bell (2020), BMC Medical Research Methodology, 20, 50 | Puissance du khi-deux et d’un GLMM avec données manquantes | 2, 3, 8 |
| Ségalas, Helmer, Genuer et Proust-Lima (2024), Statistics in Medicine | ACP fonctionnelle et modèles mixtes avec données manquantes | 3–4, 8 |