STT-7360 — Méthodes biostatistiques
Études de cas
Trois articles, trois séances · non évaluées, mais essentielles pour le travail de synthèse et l’examen.
Format
Avant chaque séance d’étude de cas :
- lire l’article ;
- remplir la fiche des caractéristiques méthodologiques (objet d’intérêt, nuisance et biais, approche, critère, calcul, inférence) ;
- préparer les exercices du document de consignes, dont la reproduction de résultats de l’article en R.
La séance alterne la discussion de la fiche, la théorie des notes et la correction des exercices. Chaque document de consignes contient la fiche vierge et une grille d’autoévaluation. Les articles et les données sont déposés sur Brio.
Étude de cas 1 · 12 février
Effets intra et inter-grappes. Neuhaus, J. M. et McCulloch, C. E. (2006). Separating between- and within-cluster covariate effects by using conditional and partitioning methods. JRSS B, 68(5), 859–872.
Corrélation entre effets aléatoires et covariables, décomposition intra/inter, régression logistique conditionnelle. Données : naisga.csv.
Étude de cas 2 · 26 février
Estimation ciblée de l’effet d’un biomarqueur. Tuglus, C. et van der Laan, M. J. (2011). Targeted methods for biomarker discovery. Ch. 22 de van der Laan et Rose, Targeted Learning. Springer.
Paramètre d’importance d’une variable, TMLE, inférence par la courbe d’influence. Données : golub (module multtest) et genes_select.RDS.
Étude de cas 3 · 2 avril
Échantillonnage à deux phases et erreur de mesure. Breslow, N. E. et Chatterjee, N. (1999). Design and analysis of two-phase studies with binary outcome applied to Wilms tumour prognosis. Applied Statistics, 48(4), 457–468.
Vraisemblance pondérée, pseudo-vraisemblance et maximum de vraisemblance semi-paramétrique. Données : fichiers NWTS (cohorte, cas-témoins, échantillon équilibré).